微生物定序

NGS 服務

微生物基因組NGS定序服務

NGS定序
特點
基龍米克斯提供了 illumina 短讀長與 PacBio 長讀長兩種高通量定序平台，讓臨床醫師與科研人員可依照自己的實驗目的需求，選擇最適合的定序方案。

介紹

微生物 (microbes) 廣泛存在於生物體、動植物、海洋、泥土等環境中，這些微生物族群的總合稱為微生物相 (microbiome)，其基因體總和則稱為「總體基因體學 (Metagenomics)」。它們是地球環境演化的關鍵參與者，也在生態環境保護與經濟發展中發揮重要作用。

微生物相是人體第二大基因體 (Second Genome)！

人體細胞大約有 40 兆個，研究發現人體細胞和微生物數量幾乎相近、甚至更多1！目前已知腸道微生物約有 1000 多種，和人體不重複的基因數總和就高達 3,300,000 以上2，因此腸道菌群被稱為人類的第二基因體  (Second Genome)，人體的健康、免疫、代謝與疾病狀態和腸道菌相有著密切關係。

註1 Valeria D’Argenio, Francesco Salvatore. The role of the gut microbiome in the healthy adult status. Clinica Chimica Acta. 451, Part A, 7 December 2015, 97-102.
註2 Luke K Ursell et al. Defining the Human Microbiome. Nutr Rev. 2012 Aug; 70(Suppl 1): S38–S44.
 

  • 第一期人類微生物組計畫 (Human Microbiome Project 1, HMP1, 2018-2012)

利用 16S rDNA 定序和總體基因體學定序 (whole metagenome shotgun sequencing)，分析了來自鼻腔、口腔、皮膚、腸胃道、生殖泌尿道的微生物組成，與其所涉及到的代謝途徑等生物功能。

 

  • 第二期人體微生物組計畫 (Integrative Human Microbiome Project, iHMP, 2013-2016)

主要是利用多體學 (Multi-Omics) 的研究方式，分析疾病發展過程中，微生物組的基因體、蛋白體、代謝體，以及宿主免疫與各項生化指標所發生的變化。

這些國際計畫奠定了人體微生物項研究基礎，為個人疾病管理、疾病檢測與健康規劃提供了新的產業脈動！


應用

  • 環境污染修復和微生物菌相之關聯
  1. 水體微生物修復
  2. 污染土壤微生物修復 
  3. 環境微生物菌劑
  4. 空氣微生物指數
  • 農業經濟和微生物相之關聯
  1. 土壤微生物和經濟作物生長、產量之關聯
  2. 植物共生菌和生長、產量之關聯
  3. 經濟動物體內菌相和健康、品質、產量之關聯
  • 人體健康、免疫、代謝與疾病狀態之研究
  1. 糞便治療與移植以治療 Clostridium difficile 反覆感染
  2. 攝取益生菌以調整體質與免疫力
  3. 飲食管理對於腸內菌相的改善
  4. 腸道菌相和大腸直腸癌的關連
加入詢問單 (0)

規格與訂購資訊

Shotgun Metagenomics Sequencing 直接萃取含有複雜族群樣品 gDNA mixture，以物理性方式將 DNA 片斷化並且建庫定序，其方法可組裝出微生物基因體，得知菌相複雜度和豐富度，並做到基因註釋與功能性分析。
16S rDNA Sequencing 取得複雜族群樣品 gDNA mixture，以 PCR 方式進行 16S 變異區域進行放大並且建庫定序，根據其序列變異和豐富度，以達到菌相分類之目的。
回到列表
TOP