加州大學聖地亞哥分校表觀基因組學中心表觀基因組副主任David Gorkin博士分享他使用PIXUL高通量超音波破碎儀的過程,並介紹了其相對於其他超音波破碎儀的優勢。

影片:http://www.youtube.com/watch?v=bTeo1aMarSE&feature=emb_logo

 

NGS 的應用中(例如ChIP-Seq、RNA-Seq、RIP-Seq、exome sequencing 以及 whole genome sequencing)都需要將樣品精確地片段化成 200-600 bp 大小的核酸片段,才能與短讀 (short read) 的NGS設備相容(如:Illumina)。

與常見的酵素片段法不同,透過超音波進行物理性片段化是更好的選擇,因為沒有酵素的切位選擇和喜好性問題且不易受核酸立體結構影響,更容易製備相對狹窄的片段。

 

大多數目前市面上的超音波處理系統無法支援高通量樣品處理,或者是需要使用昂貴的耗材來搭配使用。 PIXUL是市面上第一個也是唯一的多樣品高通量超音波破碎儀,可同步處理多達96個樣品,提供極其一致的剪切力,且操作快捷,簡單又便宜。

 

非常適合 NGS 使用。

 

  • 同時處理1-96個樣品,避免NGS應用中的樣品剪切瓶頸,大幅提升效率。
  • 在單個96孔盤上可以操作12種獨特的超音波處理條件,因此可以同時處理多種樣品類別並快速優化困難樣品的片段化條件
  • 可和純化樣品、細胞或組織中的染色質,DNA,RNA和蛋白質相容
  • 經濟的耗材使樣品處理成本更優惠
  • 15分鐘的 coupling fluid circulation 避免了冗長的 water degassing 過程

 

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操作說明書

 

PIXUL高通量超音波破碎儀

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